借地権の場合は、建物のみが借地人の所有となるため、建物だけに抵当権が設定されます。さらに、借地権は地主の意向に大きく影響を受ける不動産であることと、将来売却をするときにも、所有権物件よりも圧倒的に供給数が少ないため、明確な相場が存在していないことなどから、銀行も融資し難いのが実態です。

存続期間が満了となる前に地主や借地人に相続があったり、当事者間でも更新についてどのような取り決めをしたのか記録に残っていなかったりして、トラブルになることがあります。
更新に関するトラブルの多くが、更新料の支払いと更新拒絶の問題です。

借地権付きの土地では、毎月地主に地代を支払わなければなりませんが、地代の値上げを巡ってトラブルになることは多いです。借地権者と借地権設定者では、借地権設定者、つまり地主のほうが強い立場になりやすく、場合によっては正当な理由なく地代の値上げを宣告されることもあります。