ロングとは買い持ち、ショートとは売り持ちのことです。
ロングとは買いのポジションをとっている状態、ショートとは売りのポジションをとっている状態状態です。

そして米ドルと円の通貨ペアであれば必ずUSDJPY（ドル円）であり、JPYUSD（円ドル）と逆になることはありません。
日本人からすれば円が基準かもしれませんが世界では米ドルの方が基準となるからです。

この様に通貨ペアの最初に来る通貨の方が、基準になりますから、USDJPYの買いと言えば、ドルを買って円を売ると言う事で、USDJPYの売りと言えば、ドルを売って円を買うと言う事です。
ですからUSDJPYショートであればドルを売って円を買うポジションをとると言う事です。