運送会社の大手の日通さんも旅行会社を展開しており、
その日通旅行さんでもESTAの代行申請が可能のようです。
旅券印紙代、証紙代及び当該国に支払う査証料、審査料は別途申し受けます。
との記載があるので総額は非常に高価となります。