つまりどちらかと言えば、ハルヒにとって建設的な意味合いではなく、破壊的な方でループしている訳です。
ハルヒの記憶がリセットされているとは言え、キョンなどの近しい人間の違和感は回を追うごとに増して行き、劇中もその彼らの表情をハルヒが察知し首を傾げる描写があります。
その自他との差異にいずれハルヒがストレスを抱える事になったとしても不思議は無く、そうなれば古泉グループにとってこのループは安定した平和からは遠ざかります。

そして、長門サイドにとってもそれは危惧すべき状況に成り得ます。
仮に平和ループが続いたとして、その確定的な永劫の安定は、長門たちの求める「自律的進化」の為の観測対象として果たして適当であるか疑わしい。
１万何千回程度なら時空を超越する宇宙人(有機ベースの長門は別)にとって何でもないレベルなのでしょうが、それが無限に近付けば近付くほど、進化とは掛け離れた物になって行くと考えられます。
勿論、いくら鋼のメンタルとは言え、長門本人がそれに耐えられるとは思えない。か弱い女子な訳ですから。