自然の素材なので、どうしても誤差が生じてきます。無垢材であれば、乾燥による反りやねじれ、割れや変色することもあります。珪藻土や漆喰などの塗り壁の場合は、乾燥から生じるクラック（ひび）、また塗りムラや素材のばらつきが出る可能性もあります。しかし、メリットの方でも述べたように、それらの欠点も含めて時間を経るごとに天然の素材のいい味となるので、こうしたデメリットを楽しむ余裕があるといいかもしれません。