2社間ファクタリングは自社とファクタリング会社の2社だけで行うものです。この形だと、得意先とファクタリング会社は繋がりが全くありません。売掛金による現金のやりとりは、従前どおり自社と得意先のみです。ファクタリング会社は自社が回収した売掛金をファクタリング会社に支払います。
対して、3社間ファクタリンングの場合は、得意先からファクタリング会社に売掛金が支払われます。自社も含め3社合意の上でファクタリングが行われます。
ファクタリング会社にすると、2社間では最初に自社に売掛金の立替えとして回収の見込み金額を自社に支払います。そして、自社が回収後ファクタリング会社に返済・支払われます。この時、得意先からの回収で「自社」が1社噛んで支払われるため、リスクが高くなるという判断がされます。それよりはファクタリング会社は、得意先から直接売掛金を支払ってもらう方がリスクは少ないのです。得意先の経営状況を事前に審査してた上で、ファクタリング契約をしているので、得意先は優良な会社であることが前提だからです。