中絶手術は、たとえ初期でも、手術である以上は体へのリスクが伴います。考えられるリスクとしては、まず初期中絶の場合、掻爬や吸引の際に子宮に穴があいたり(子宮穿孔)、組織の一部が残ったりすることなどがあります。中期中絶では、薬の影響で陣痛が強くなりすぎて子宮が破裂することも。

子宮内感染を起こして、不妊になるケースもあるので注意が必要です。