個人で行う種々の契約手続きやキャッシュフローを一括して管理・利用出来るところまで行ってくれるのが決済代行サービスなので、相応の手数料が計上されます。具体的な部分は各会社によると思いますが、基本的には初期手数料・運営手数料・各決済事の手数料となる様です。