NLP（神経言語プログラミング）が誕生後、複雑な過程をふんで発展してきたという経緯に答えがあります。
協会は、大きく分けて以下の2つ。

創始者の作った団体（米国NLP協会）
創始者が作ったNLPを発展させた新しい団体（全米NLP協会）
現在、日本における協会は、後者（全米）の流れを汲んだ「日本NLP協会」ひとつです。ただし、この設立までは、日本でも、創始者の団体（米国）が主流でした。