私はGooglePlayStoreの審査でリジェクトされた経験がなく、リジェクト後の対応についてはお話することが出来ませんので、ここではiTunesConnectにおける審査の対策・対応についてお話します。

審査がリジェクトされたとき、Appleは開発者側に理由を教えてくれます。
ただし、あくまで審査担当者から見た却下理由であり、その根本的な原因は環境だったりプログラムのバグだったり、メタデータ(アプリの情報)が不十分だったりと様々です。