コンピューターを使用して設計と生産を徹底的に合理化しているため、その工場の機能性を高める事が優先されますので、その工場の外観のデザイン面での自由度があまり無いという点が「システム建築」のデメリットとなっています。
機能性は非常に優れた工場でありながら、見た目は至って平凡となってしまう事が多いのが、「システム建築」による設計なのです。