性交痛は挿入時（表皮部または腟入口部），より深い挿入，陰茎が動くとき，または性交後に起こることがある。

自発的な筋性防御および意図しない筋緊張亢進として現れる一部の骨盤底筋の緊張亢進が，全てのタイプの慢性性交痛において一般的である。

性交痛を感じる場所は主に２つに分けられます。

１）腟の入口付近の性交痛 (外陰部や陰唇など、膣開口部周辺)

２）腟の奥の性交痛 (骨盤内で感じる痛み)

性交痛がひどい場合、子宮内膜症やその他の病、炎症にかかっていることもあり、適切な処置が求められます。

女性の場合は特に、ストレスによってホルモンバランスが大きく乱れることがあります。その結果、腟潤滑液の分泌が不十分になり、うるおいが不足します。

外陰部、膣、膣両側にある分泌腺の炎症や性器ヘルペス、尿道の炎症でも痛みが生じる場合があります。

性感染症が原因となっていることもあります。

きちんと検査を受けて治すことで痛みを改善する事ができます。

原因として多いのは、初体験（破瓜）・久々のセックス・男性のサイズと合わない・乱暴なプレイなど。

また、出産後のセックスに痛みや違和感を覚え、セックスに不安や恐怖を感じてしまう女性もいます。

性交痛の身体的な要因としては、病気や疾患の可能性があげられます。

子宮内膜症、子宮筋腫、子宮周囲の癒着、子宮内、膣内の奇形、会陰神経（膣口にある）と膣神経（膣上半分にある）と呼ばれる神経が露出してしまい、そこに痛みを感じる、一部膣内に皮膚のかたよりがあるなど