物語の舞台は西暦2095年の未来社会で、魔法が科学技術として実用化されています。この世界では、魔法を使いこなすための技術が重要視されており、その技術を学ぶためのエリート学校が「魔法科高校」です。ここでは、魔法技術を磨くために厳しい競争が繰り広げられ、学生たちは日々研鑽を積んでいます。