死神武器職人専門学校、通称「死武専」に通うマカとソウルは、ソウルを最強の武器である「デスサイズ」へと進化させるため、99個の「卵の魂」と1つの「魔女の魂」を集める旅に出ます。道中、様々な敵や困難に立ち向かいながら成長していくマカとソウル。やがて、彼らは世界の運命を左右する大きな戦いに巻き込まれていきます。ブラック☆スターと椿、キッドとパティ&リズもまた、それぞれの試練を乗り越えながら、力を合わせて鬼神に立ち向かいます。物語は、壮大なスケールで展開し、友情や愛情、そして正義と悪といった普遍的なテーマを描いています。