単純にキレイな車体であれば、買取後にかかる人件費を抑えられるので、その分を引かれずに済むのです。
またプロとはいえ、査定員も人間です。手入れの行き届いたバイクに安い価格を付けるのは気が進まないものですし、「適当な額では売らないだろうな」という印象を与えられます。